1.有机食品的生产、加工标准与绿色和无公害食品不同。

有机食品生产过程强调以生态学原理为基础，建立一个种养结合、循环再生的完整体系，尽量减少对外部物质的依赖，禁止使用一切人工合成的农用化学品；而绿色和无公害食品则强调减少农药化肥的使用与规范使用的方法、时间、次数来降低农用化学品的污染。

2.有机食品的检查认证和管理方法与绿色和无公害食品不同。

有机食品强调生产全过程的管理，其理论依据是有好的过程必定有好的结果；而绿色食品非常注重生产环境和产品的检测结果。

3.有机食品的认证管理方式与绿色和无公害食品不同

有机食品要求每年都要接受至少一次检查认证，而绿色食品一次认证有效期为3年。